Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tnip2Q99JG7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnip2Q99JG7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms