Protein–RNA interactions for Protein: Q99J25

Mrm1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrm1Q99J25 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrm1Q99J25 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrm1Q99J25 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrm1Q99J25 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrm1Q99J25 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrm1Q99J25 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrm1Q99J25 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrm1Q99J25 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrm1Q99J25 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrm1Q99J25 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrm1Q99J25 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrm1Q99J25 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrm1Q99J25 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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