Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim11aQ99J19 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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