Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms