Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CsprsQ99388 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CsprsQ99388 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.8 ms