Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf112Q96DY5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms