Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Slc8b1Q925Q3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Slc8b1Q925Q3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Slc8b1Q925Q3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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