Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf144aQ925F3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf144aQ925F3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf144aQ925F3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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