Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp3Q923K4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms