Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf3Q922U1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms