Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip1Q922J3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms