Protein–RNA interactions for Protein: Q921V7

Slc44a3, Choline transporter-like protein 3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a3Q921V7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc44a3Q921V7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms