Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms