Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin3bQ91ZU9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin3bQ91ZU9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin3bQ91ZU9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin3bQ91ZU9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin3bQ91ZU9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin3bQ91ZU9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms