Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atpaf2Q91YY4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms