Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms