Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms