Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm4sf4Q91XD3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms