Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms