Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms