Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NifkQ91VE6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NifkQ91VE6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.04■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NifkQ91VE6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NifkQ91VE6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NifkQ91VE6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms