Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps3Q91VB4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms