Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms