Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt79Q8VED5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms