Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms