Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TgdsQ8VDR7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms