Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D1

Slc9a8, Sodium/hydrogen exchanger 8, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a8Q8R4D1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc9a8Q8R4D1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms