Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccdc58Q8R3Q6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccdc58Q8R3Q6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccdc58Q8R3Q6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc58Q8R3Q6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc58Q8R3Q6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc58Q8R3Q6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc58Q8R3Q6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc58Q8R3Q6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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