Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R3C1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R3C1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8R3C1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms