Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2D1

Vmn1r22, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r22Q8R2D1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r22Q8R2D1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r22Q8R2D1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r22Q8R2D1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r22Q8R2D1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r22Q8R2D1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r22Q8R2D1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r22Q8R2D1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r22Q8R2D1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r22Q8R2D1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r22Q8R2D1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r22Q8R2D1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r22Q8R2D1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r22Q8R2D1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms