Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1M2

H2afj, Histone H2A.J, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afjQ8R1M2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
H2afjQ8R1M2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2afjQ8R1M2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
H2afjQ8R1M2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
H2afjQ8R1M2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H2afjQ8R1M2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H2afjQ8R1M2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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H2afjQ8R1M2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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H2afjQ8R1M2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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H2afjQ8R1M2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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H2afjQ8R1M2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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H2afjQ8R1M2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afjQ8R1M2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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