Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT4

Crb3, Protein crumbs homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb3Q8QZT4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Crb3Q8QZT4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crb3Q8QZT4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms