Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms