Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms