Protein–RNA interactions for Protein: Q8K301

Ddx52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx52Q8K301 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx52Q8K301 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms