Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms