Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms