Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo18Q8K2I9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms