Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms