Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1eQ8K202 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1eQ8K202 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1eQ8K202 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1eQ8K202 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1eQ8K202 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1eQ8K202 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1eQ8K202 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1eQ8K202 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1eQ8K202 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1eQ8K202 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1eQ8K202 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms