Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Nek9Q8K1R7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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