Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot3Q8K0V4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms