Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms