Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc4a8Q8JZR6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms