Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms