Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms