Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIL4

Uncharacterized protein C1orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CIL4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CIL4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CIL4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CIL4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CIL4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CIL4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CIL4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms