Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms