Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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