Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28bQ8CEG5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccdc28bQ8CEG5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28bQ8CEG5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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